Publications



(accepté) Fabry, P., Barton, A., Ethier, J.-F. Version control for interdependent ontologies: challenges and first propositions. In Proceedings of the International Conference on Biomedical Ontologies 2023 (ICBO 2023).
(accepté) Barton, A., Vieu, L., Éthier, J.-F. Filling with Nothing – An Ontological Analysis of Empty Information. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2023 (JOWO 2023). 7th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST VII).
(accepté) Toyoshima, F., Barton, A. Foundations for a Realist Ontology of Mental Representation. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2023 (JOWO 2023). Cognition and Ontologies (CAOS VII) .
(accepté) Toyoshima, F., Barton, A. Two Approaches to the Identity of Processes in BFO. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2023 (JOWO 2023). 7th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST VII).
(2023) Cumyn, A., Ménard, J. F., Barton, A., Dault, R., Lévesque, F., & Ethier, J. F. Patients and Members of the Public’s Wishes Regarding Transparency in the Context of Secondary Use of Health Data: A Scoping Review. Journal of Medical Internet Research, 25, e45002.
(accepté) Goyer, F., Fabry, P., Barton, A., Ethier, J.-F. An ontology for healthcare systems. In Proceedings of the International Conference on Biomedical Ontologies 2022 (ICBO 2022).
(accepté) Toyoshima, F., Barton, A., Ethier, J.-F. An Ontological Approach to Developing a Unified and Interdisciplinary Framework for Aging. In Proceedings of the International Conference on Biomedical Ontologies 2022 (ICBO 2022).
(2022) Toyoshima, F., Barton, A., Ethier, J.-F. Affordances and their ontological core. Applied Ontology 17:2, 285–320.
(2022) Khnaisser, C., Lavoie, L., Fraikin, B., Barton, A., Dussault, S., Burgun, A., Ethier, JF. Using an ontology to derive a sharable and interoperable relational data model for heterogeneous healthcare data and various applications. Methods of Information in Medicine, 61(S 02):e73-e88. doi: 10.1055/a-1877-9498.
(2022) Barton, A., Tarbouriech, C., Vieu, L., Ethier, J.-F. A Mereological System for Informational Templates. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2022 (JOWO 2022). 6th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST), CEUR Workshop proceedings, Vol 3249.
(2022) Toyoshima, F., Barton, A., Ethier, J.-F. Investigating Functions in BFO from the Viewpoint of Extrinsic Dispositions. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2022 (JOWO 2022). 6th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST), CEUR Workshop proceedings, Vol 3249.
(2022) Fabry, P., Goyer, F., Barton, A., Ethier, J.-F. An Informational Perspective on the Ontology of Services. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2022 (JOWO 2022). International Workshop on Ontologies for Social Services (OSS), CEUR Workshop proceedings, Vol 3249.
(2022) Fabry, P., Goyer, F., Barton, A., Ethier, J.-F. An Ontological Analysis of Health Procedure Information. In ICBO 2021 - International Conference on Biomedical Ontologies 2021, CEUR Workshop proceedings, Vol-3073, 36-47.
(2022) Toyoshima, F., Barton, A., Fabry, P., Ethier, J.-F. Representing Gender in Ontologies: A Dispositional Perspective. In ICBO 2021 - International Conference on Biomedical Ontologies 2021, CEUR Workshop proceedings, Vol-3073, 1-12.
(2022) Barton, A. Foundations for an Ontology of Nudges. In ICBO 2021 - International Conference on Biomedical Ontologies 2021, CEUR Workshop proceedings, Vol-3073, 174-183.
(2021) Toyoshima, F., Barton, A., Jansen, L., Ethier, J.-F. Towards a Unified Dispositional Framework for Realizable Entities. In B. Brodaric, F. Neuhaus (Eds.), Formal Ontology in Information Systems. Proceedings of the 12th International Conference (FOIS 2021). IOS Press.
(FOIS 2021 Distinguished Paper Award)
(2021) Cumyn, A., Barton, A., Dault, R. Safa, N., Cloutier, A.-M., Ethier, J.-F. Meta-consent for the secondary use of health data within a learning health system: a qualitative study of the public’s perspective. BMC Medical Ethics 22, 81.
(2021) Barton, A., Vieu, L., Éthier, J.-F. Expressions, Utterances and Directive Slots. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). 5th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2969.
(2021) Tarbouriech, C., Barton, A., Vieu, L., Éthier, J.-F. The Counting Problem of Slot Mereology. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). 5th International Workshop on Foundational Ontologies (FOUST), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2969.
(2021) Tarbouriech, C., Bernard, D., Vieu, L., Barton, A., Éthier, J.-F. Flight Procedures Description Using Semantic Roles. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). 11th International Workshop on Formal Ontologies meet Industry (FOMI), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2969.
(2021) Toyoshima, F., Barton, A., Jansen, L., Ethier, J.-F. How an Aggregate View of Social Roles Meets Dispositions. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2021 (JOWO 2021). 2nd International Workshop on Ontology of Social, Legal and Economic Entities (SoLEE), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2969.
(2021) Le Bihan, B. & Barton, A. Analytic Metaphysics Versus Naturalized Metaphysics: The Relevance of Applied Ontology. Erkenntnis, 86, 21-37. https://doi.org/10.1007/s10670-018-0091-8
(2021) Ethier, J. F., Goyer, F., Fabry, P., Barton, A.. The Prescription of Drug Ontology 2.0 (PDRO): More Than the Sum of Its Parts. International Journal of Environmental Research and Public Health,  18:22, 12025.
(2021) Barton, A., Toyoshima, F., Ethier, J.-F. Clinical Documents and Their Parts. In J. Hastings & F. Loebe (Eds.), ICBO|ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies 2020, CEUR-WS.org, A.1-11.
(2021) Fabry, P., Barton, A., Ethier, J.-F. QUESTO – An Ontology for Questionnaires. In J. Hastings & F. Loebe (Eds.), ICBO|ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies 2020, CEUR-WS.org, B.1-12.
(2021) Fabry, P., Barton, A., Ethier, J.-F. An Ontological Representation of Sex and Gender Information. In J. Hastings & F. Loebe (Eds.), ICBO|ODLS 2020 International Conference on Biomedical Ontologies 2020, CEUR-WS.org, O.1-5.
(2021) Grenier, O. & Barton, A. Vers une Ontologie Dispositionnelle du Risque. Lato Sensu: Revue de la Société de philosophie des Sciences, 8:2, 58-69
(2021) Cumyn, A., Dault, R., Barton, A., Cloutier, A.-M., Ethier, J.-F. Citizens, Research Ethics Committee Members and Researchers’ Attitude Toward Information and Consent for the Secondary Use of Health Data: Implications for Research Within Learning Health Systems. Journal of Empirical Research on Human Research Ethics, https://doi.org/10.1177/1556264621992214
(2021) Barton, A. & Rano, Q. Les frontières de l’évasion : Une taxonomie du jeu d'évasion, Sciences du jeu, 16.
(2020) Barton, A., Toyoshima, F., Vieu, L., Fabry, P., Ethier, J.-F. The Mereological Structure of Informational Entities. In B. Brodaric, F. Neuhaus & M. Katsumi (Eds.), Formal Ontology in Information Systems. Proceedings of the 11th International Conference (FOIS 2020). IOS Press.
(2020) Toyoshima, F., Barton, A., Grenier, O. Foundations for an Ontology of Belief, Desire and Intention. In B. Brodaric, F. Neuhaus, & M. Katsumi (Eds.), Formal Ontology in Information Systems. Proceedings of the 11th International Conference (FOIS 2020). IOS Press.
(2020) Barton, A., Toyoshima, F., Ethier, J.-F. Approaching Roles with Affordances. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2020 (JOWO 2020). The Joint Ontology Workshops 2020. Workshop on Foundational Ontology (FOUST IV).
(2020) Toyoshima, F., Barton, A., Ethier, J.-F. Functional Parthood: A Dispositional Perspective. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2020 (JOWO 2020). The Joint Ontology Workshops 2020. Workshop on Foundational Ontology (FOUST IV).
(2019) Barton, A., Fabry, A., Ethier, J.-F. A Classification of Instructions in Drug Prescriptions and Pharmacist Documents. In A. D. Diehl, W. D. Duncan & G. Sanso (Eds.), Proceedings of the 10th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2019), CEUR Workshop Proceedings, vol. 2931, 1–7.
(2019) Cumyn, A., Barton, A., Dault, R., Cloutier, A., Jalbert, R., Ethier, J.-F. Informed consent within a learning health system: A scoping review. Learning Health Systems. doi: 10.1002/lrh2.10206
(2019) Barton, A., Vieu, L. & Ethier, J.-F. Directing Actions. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops (JOWO-2019), Workshop on Foundational Ontology (FOUST III), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2518, 1-10.
(2019) Barton, A., Fabry, P., Lavoie, L., & Ethier, J.-F. LABO: An Ontology for Laboratory Test Prescription and Reporting. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops (JOWO-2019), Ontologies and Data in Life Sciences (ODLS 2019), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2518, 1-9.
(2019) Masolo, C. & Barton, A.. The Identity of Property Particulars. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops (JOWO-2019), Workshop on Foundational Ontology (FOUST III), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2518, 1-10.
(2019) Toyoshima, F. & Barton, A.. Linking Image Schemas with Affordances: An Ontological Approach. In: Proceedings of the Joint Ontology Workshops (JOWO-2019), Cognition And OntologieS (CAOS-IV), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2518, 1-9.
(2019) Toyoshima, F. & Barton, A. A Formal Representation of Affordances as Reciprocal Dispositions. In O. Kutz and M. M. Hedblom (Eds.), Proceedings of TriCoLore 2018 - Creativity | Cognition | Computation, CEUR Workshop Proceedings, vol. 2347, 1-14.
(2018) Barton, A., Grenier, O., & Ethier, J.-F. The Identity and Mereology of Pathological Dispositions. In Cooper, L., Jaiswal, P., Haendel, M. & Mungall, C. (Eds.), Proceedings of the International Conference on Biological Ontology (ICBO-2018), CEUR Workshop Proceedings, vol. 2285, 1-6.
Cet article applique nos théories de la méréologie et de l'identité des dispositions à plusieurs dispositions pathologiques : maladies, risques médicaux, et prédispositions.
(2018) Ethier, J.-F., Barton, A. & Taseen, R. An ontological analysis of drug prescriptions. Applied Ontology, 13(4), 273-294.
(2018) Barton, A., Duncan, W., Toyoshima, F. & Ethier, J.-F. First steps towards an ontology of belief. In: Porello, D., Masolo, C., Scheider, S, Jansen, L., Radicioni, D.P. & Gromann, D. (Eds.), Proceedings of the Joint Ontology Workshops (JOWO-2018), Second International Workshop on Epistemology in Ontologies (EPINON II), 1-5.
(2018) Barton, A., Grenier, O., Jansen, L., & Ethier, J.-F. The identity of dispositions. In: Borgo, S., Hitzler, P. & Kutz, O. (Eds.), Proceedings of the 10th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2018), Amsterdam:IOS Press, Vol. 306, 113-126.
(2018) Barton, A., Jansen, L., Rosier, A. & Ethier, J.-F. What is a risk? A formal representation of risk of stroke for people with atrial fibrillation. In: Horridge, M., Lord, P. & Warrender, J.D. (Eds), Proceedings of the 8th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2017), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2137, 1-6.
Nous proposons une représentation ontologique du risque médical dans le contexte de la OBO Foundry. Ce cadre est appliqué au cas du risque d’accident vasculaire cérébral (AVC) pour les individus faisant de la fibrillation atriale (FA), pour lequel nous dissocions trois classes de dispositions : la maladie FA ; le risque d’AVC pour un humain qui fait de la FA ; et le risque d’AVC sur 12 mois pour un humain qui fait de la FA. Cette dernière disposition peut être quantifiée par des estimations du risque, qui sont des entités informationnelles extraites de documents – telles que des articles de journaux scientifiques – et auxquelles peuvent être assignées des valeurs de probabilités épistémiques. Nous discutons du problème de la classe de référence (à savoir la possibilité d’avoir plusieurs estimations du risque avec différentes probabilités épistémiques pour le même individu, selon la classe de référence utilisée pour cette estimation du risque) et clarifions les hypothèses philosophiques sur lesquelles ce cadre dispositionnel est fondé.
(2018) Barton, A., Khnaisser, K., Lavoie, L. & Ethier, J.-F. Ambiguities in medical bitemporalized relational databases: A referent tracking view. In: Boeker, M., Herre, H., Jansen, L., Loebe, F., Schober, D., Borgo, S., Kutz, O.,  Loebe, F. & Neuhaus, F.  (Eds), ODLS: Ontologies and data in life sciencesProceedings of the Joint Ontology Workshops 2017 (JOWO-2017), CEUR Workshop proceedings, Vol. 2050, 1-5.
Nous montrons qu’une application classique des bases de données relationnelles temporalisées aux données médicales soulève plusieurs ambiguïtés, qu’une représentation à base d’ontologies permettrait d’éviter.
(2018) Barton, A., Jansen, L., & Ethier, J.-F. A taxonomy of disposition-parthood. In: Galton, A., Neuhaus, F., Borgo, S., Kutz, O. & Loebe, F. (Eds), FOUST II: 2nd Workshop on Foundational Ontology, Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017 (JOWO-2017), CEUR Workshop proceedings, Vol. 2050, 1-10.
Cet article propose une analyse ontologique des différentes relations méréologiques (de tout à partie) qui peuvent être définies entre dispositions (des entités telles que la fragilité ou la solubilité, qui sont fréquemment invoquées pour analyser les pouvoirs causaux). Nous proposons une série d’axiomes reliant les porteurs, déclencheurs et réalisations des dispositions et de leurs parties. Nous considérons quels axiomes de composition et de décomposition sont satisfaits par ces relations.
(2018) Ethier, J. F., McGilchrist, M., Barton, A., Cloutier, A. M., Curcin, V., Delaney, B. C., & Burgun, A. The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and interoperability requirements to support primary care. Learning Health Systems, 2(2), e10037.
Cet article présente la preuve de concept de système de santé apprenant TRANSFoRm, qui a permis l'intégration les données issues de cinq systèmes d’information médicale à travers quatre pays européens. Il a permis de soutenir la recherche prospective (de recrutement de patient pour un essai clinique), rétrospective (d’analyse de données) et d’aide à la décision, incarnant le passage d’une perspective centrée sur l’institution à une perspective centrée sur le patient.
(2017) Barton, A., Ethier, J.-F., Duvauferrier, R. & Burgun, A. An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. Journal of Biomedical Semantics, 8(1). DOI 10.1186/s13326-016-0099-4.
Cet article propose une représentation, au sein de l’ensemble d’ontologies biomédicales OBO Foundry, des indicateurs de performances diagnostiques de tests médicaux : sensibilité, spécificité, valeur prédictive positive et valeur prédictive négative. Cette représentation prend en compte l’ « effet de spectre », à savoir la dépendance de la sensibilité et de la spécificité envers la population en considération. La sensibilité, qui est relative à une population générale, est clairement distinguée de l’estimation de sensibilité, qui est relative à un échantillon de cette population. Ceci soulève une difficulté pour une représentation au sein d’une ontologie réaliste, qui ne peut représenter que des entités actuelles : alors qu’une estimation de sensibilité peut être définie comme une proportion actuelle (la proportion de personnes qui ont obtenu un résultat positif, parmi les personnes malades dans l’échantillon), la sensibilité est quant à elle définie comme une proportion non-actuelle (la proportion de personnes qui obtiendraient un résultat positif si elles étaient testées, parmi les personnes malades dans la population générale). Cette difficulté est résolue par l’introduction de dispositions, qui permettent d’interpréter la sensibilité et la spécificité comme des probabilités associées à certaines dispositions présentées dans l’article.
(2017) Barton, A. & Jebari, K. Le libre-arbitre dans l’interprétation d’Everett de la mécanique quantique. Igitur, 8(2), 1-11.
Nous montrons que l’interprétation d’Everett de la mécanique quantique implique la satisfaction de deux principes importants pour le libre-arbitre. Le premier est le principe des possibilités alternatives, qui affirme que si un individu a agi par libre arbitre, il aurait pu agir autrement (nous utilisons pour notre démonstration la théorie de l’identité personnelle de Ted Sider, et une analyse de la modalité inspirée de la théorie des contreparties de David Lewis). Le second est le principe de contrôle déterminant antécédent – l’idée qu’un agent a la capacité de déterminer à l’avance quelle option parmi plusieurs va se produire. L’interprétation d’Everett apporte ainsi un souffle nouveau au projet compatibiliste qui vise à démontrer la compatibilité du déterminisme et du libre-arbitre.
La massification des données issues de sources hétérogènes invite à mettre au point des outils de traitement de l’information rendant possible leur interopérabilité sémantique. Les ontologies appliquées ont été développées dans cet objectif. Nous montrons dans cet article en quoi l’ontologie philosophique à un rôle central à jouer pour l’ontologie appliquée, notamment biomédicale ; et réciproquement, en quoi l’ontologie appliquée éclaire certaines problématiques classiques d’ontologie philosophique, en prenant pour exemple la question suivante : les maladies sont-elles des espèces naturelles ?
(2016) Ethier, J.-F., Taseen, R., Lavoie, L. & Barton, A. Improving the semantics of drug prescriptions with a realist ontology. In: Jaiswal, P. Hoehndorf, R., Arighi, C., Meier, A. (Eds), Proceedings of the Joint International Conference on Biological Ontology and BioCreative (2016), CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2137, IT603:1-6.
Les prescriptions électroniques permettent de réduire les événements médicamenteux indésirables, mais les ambiguités, spécificités et défauts de standardisation de la sémantique de la prescription limitent leur interopérabilité, et constituent une source d’erreur potentielle. Cet article illustre certains problèmes concernant la structuration actuelle des prescriptions électroniques, et démontre comment notre ontologie des prescriptions de médicament (PDRO) aborde ces problèmes grâce à une sémantique fondée sur les principes réalistes de la OBO Foundry. PDRO complète des classes et relations importées depuis les ontologies IAO, OBI, OGMS, OMRSE et DRON. Nous analysons la logique de la prescription médicale ainsi que sa structure déontique.
(2016) Barton, A., & Ethier, J.-F. The two ontological faces of velocity. In: Ferrario, R.  & Kuhn, W. (Eds.), Proceedings of the 9th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS 2016), Amsterdam: IOS Press, 123-136.
Cet article présente une formalisation de la vitesse dans le contexte d’une ontologie réaliste et perspectiviste. Il défend la thèse que le terme « vitesse » peut faire référence à deux types d’entités différentes : une « vitesse de mouvement », qui caractérise un processus de mouvement ; et une « vitesse d’objet », une disposition qui inhère dans l’objet. Trois vitesses de mouvement sont distinguées : vitesse à gauche, vitesse à droite et vitesse bilatérale. La vitesse de mouvement peut exister sans vitesse d’objet, comme révélé par une expérience de pensée présentée par Tooley ; mais dans notre monde, la première loi de l’inertie de Newton implique que tout objet a à la fois une disposition inertielle et une vitesse d’objet. La disposition inertielle et la vitesse d’objet sont toutes deux des dispositions réalisées par la vitesse à droite ; en revanche, la vitesse à gauche est un déclencheur de la disposition inertielle, alors qu’elle est une condition d’existence de la vitesse d’objet.
(2016) Barton, A. & Jansen, L. A modelling pattern for multi-track dispositions for life-science ontologies. In: Loebe, F., Boeker, M., Herre, H., Jansen, L. & Schober, D. (Eds), Proceedings of the 7th Workshop on Ontologies and Data in Life Sciences (ODLS-2016), H1-2.
Cet article étend le modèle de disposition proposé par Röhl & Jansen (2011), en introduisant des relations entre dispositions pour formaliser les dispositions dites « à pistes multiples » (multi-track), qui peuvent avoir différentes sortes de déclencheurs et différentes sortes de réalisations. Nous suggérons des axiomes satisfaits par ces relations, et envisageons des applications possibles au domaine biomédical.
(2015) Barton, A., Duvauferrier, R & Burgun, A. Formalization of indicators of diagnostic performance in a realist ontology. In: Couto, F. M. & Hastings, J. (Eds), Proceedings of 6th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO2015), 63-70.
Cet article adapte au cadre des ontologies appliquées l’analyse dispositionnelle des indicateurs de performance de tests diagnostiques médicaux. Nous proposons une formalisation dans le cadre de l’ensemble d’ontologies interopérables réalistes OBO Foundry, en nous appuyant sur le modèle de disposition développé par Röhl & Jansen (2011). Nous formalisons les indicateurs de performance diagnostique (comme des sous-classes de 'data item', une entité issue de l'Information Artifact Ontology), ainsi que leurs relations aux dispositions en question. Nous argumentons que ce sont avant tout les indicateurs de performance diagnostique qui doivent être représentés dans ce cadre, plutôt que leurs estimations. Nous montrons que notre formalisation ne requière pas d’introduire des entités possibles, non-actuelles (telles que le résultat qu’une personne obtiendrait si un test médical était réalisé sur elle), et qu’elle est par conséquent acceptable dans une ontologie construite dans une approche réaliste, qui ne peut formaliser que des entités actuelles.
(2015) Ethier, J.-F., Curcin, V., Barton, A., McGilchrist, M., Bastiaens, H. et al. Clinical Data Integration Model: Core interoperability ontology for research using primary care data, Methods of Information in Medicine, 54(1), 16-23.
Cet article présente l’ontologie appliquée CDIM (Clinical Data Integration Model), que nous avons développée dans le cadre du projet européen TRANSFoRM, qui propose une formalisation des concepts centraux liés à la prescription et la mesure de données médicales et vise à permettre l’interopérabilité des données médicales de soin primaire issues de sources multiples. L’ontologie est téléchargeable depuis le site du projet TRANSFoRM (http://transformproject.eu/TRANSFoRmproject.eu/CDIM.html).
(2014) Barton, A., Rovetto, R. & Mizoguchi, R. Newtonian forces and causation: a dispositional account. In: P. Garbacz & O. Kutz (Eds.), Proceedings of the 8th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2014), Amsterdam: IOS Press, 157-170.
Cet article présente une formalisation des forces Newtoniennes et des relations causales dans lesquelles elles sont impliquées. Les forces gravitationnelles et électromagnétiques y sont modélisées comme des dispositions d’un objet, dont la réalisation est un mouvement accéléré (l’accélération étant relié aux forces en question par la 2nde loi de Newton). Cette formalisation se fonde sur le modèle de disposition proposé en 2011 par Röhl & Jansen, que nous étendons avec une relation supplémentaire, permettant de relier une force avec le champ local qui la cause. Nous montrons que ce modèle s’accorde avec certaines intuitions concernant la notion de force, notamment l’idée que la force est le résultat d’une interaction. Nous adaptons ce modèle aux forces de contact. Enfin, nous évoquons deux difficultés classiques en philosophie des dispositions et des forces newtoniennes. Tout d’abord, lorsque plusieurs forces (dites composantes) agissent sur un objet, aussi bien ces forces composantes que la force résultante (représentée par la somme vectorielle des forces composantes) semblent causer l’accélération de l’objet – autrement dit, il semble y avoir surdétermination causale. Par ailleurs, les dispositions semblent ne pas causer leurs effet – c’est leur base physique qui semble remplir ce rôle (autrement dit, les dispositions semblent causalement inerte ; dans notre modèle, ceci impliquerait que c’est le champ, et non la force, qui a un effet causal sur les mouvements accélérés). Nous présentons les solutions que suggère notre modèle à ces deux difficultés classiques.
(2014) Barton, A., Rosier, A. Burgun, A & Ethier, J.-F. The Cardiovascular Disease Ontology. In: P. Garbacz & O. Kutz (Eds.), Proceedings of the 8th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2014), Amsterdam: IOS Press, Vol. 267, 409-414.
(1er prix de la compétition d'ontologies de FOIS 2014)
Cet article présente CVDO (Cardiovascular Disease Ontology), une ontologie des maladies cardiovasculaires fondée sur un modèle de maladie proposé par l’ontologie OGMS (Ontology for General Medical Science) ; selon ce modèle, une maladie est une disposition de l’organisme à subir des processus pathologiques – et cette disposition existe à cause d’une structure matérielle anormale nommée « désordre ». Par exemple, l’épilepsie est considérée dans OGMS comme une disposition à subir des crises d’épilepsie (ce sont les processus pathologiques), existant à cause d’une structure cérébrale anormale (il s’agit du désordre). Nous appliquons ce modèle au cas des maladies cardiovasculaires afin d’évaluer son adéquation. Ce modèle permet de classer les maladies par raisonnement automatique, ce qui révèle certaines incohérences dans certaines classifications officielles de maladie (comme la classification des cardiomyopathies par l’OMS de 1995). Nous montrons par ailleurs qu’OGMS doit être complémentée par des règles permettant de déterminer le point final du cours d’une maladie, et de localiser la base matérielle d’une maladie dans une chaîne causale de désordres. Notre ontologie CVDO suit les principes méthodologiques de l’ensemble d’ontologies OBO Foundry, et peut être téléchargée depuis le site obofoundry.org.
(2013) Barton, A. How tobacco health warnings can foster autonomy. Public Health Ethics, 6(2), 207-219.
J’examine dans cet article le statut éthique des avis dissuasifs placés sur les paquets de cigarettes. Je distingue tout d’abord le rôle informationnel et le rôle persuasif de ces avis, et je montre que ces deux rôles permettent au fumeur dépendant de mieux s’auto-réguler. Je conclus que l’interaction de ces messages avec les facultés non-délibératives des individus, qui s’apparente à une forme de manipulation, est compensée par le gain en autonomie que ces messages permettent. Ainsi, contrairement à ce qu’une première analyse pourrait suggérer, ces avis dissuasifs peuvent renforcer l’autonomie des individus. Je soutiens en revanche que les messages trompeurs ne sont pas éthiquement justifiés et doivent être évités. Enfin, je montre que cette mesure met en évidence une différence fondamentale entre le paternalisme libertarien (qui interfère avec l’autonomie des agents) et le paternalisme classique (qui interfère avec la liberté négative des agents, au sens d'Isaiah Berlin), m’opposant en cela à l'idée d'un continuum entre ces deux formes de paternalisme.
(2013) Barton, A. Définition et éthique du paternalisme libertarien. Implications philosophiques, dossier 'L'éthique dans tous ses états', 31-56.
Je propose dans cet article une clarification conceptuelle du paternalisme libertarien, qui repose sur le concept de « nudge » (les nudges incluent par exemple la mise en évidence d’aliments sains dans une cantine, ou bien la considération des individus comme donneurs d’organes par défaut). J’y caractérise un nudge comme un arrangement de l’environnement dans lequel les individus prennent leurs décisions, visant à modifier leur comportement en interagissant avec leurs facultés non délibératives (soit en les déclenchant, soit en les bloquant). Un nudge doit par ailleurs contribuer au bien-être des individus ou à un bien commun, et ne doit imposer ni interdiction, ni changement significatif des incitatifs économiques. Je définis par la suite une mesure paternaliste libertarienne comme un nudge mis en place sans le consentement de l’individu et visant à améliorer son bien-être. Enfin, je recense les problèmes éthiques soulevés par la paternalisme libertarien ; je conclus que l’acceptation d’une mesure paternaliste libertarienne par un processus démocratique ne la rend pas nécessairement éthiquement acceptable, mais qu’elle doit également être suffisamment transparente pour pouvoir être évitée par les individus qui le souhaitent.
(2012) Barton, A., Burgun, A. & Duvauferrier, R. Probability assignments to dispositions in ontologies. In: M. Donnelly & G. Guizzardi (Eds.), Proceedings of the 7th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS-2012), Amsterdam: IOS Press, 3-14.
Cet article examine comment formaliser les assignations de probabilités aux dispositions dans une ontologie formelle, en suivant une approche poppérienne. Considérons D un universel de disposition (par exemple, la disposition d’une pièce à tomber sur face lors d’un lancer à pile ou face) associé à un déclencheur T (le lancer à pile ou face) et une réalisation possible R (le processus de tomber sur face) ; et considérons une instance de D notée d (une disposition à tomber sur face d’une pièce particulière). L’article montre comment formaliser une assignation de probabilités aux triplets (d,T,R) et (D,T,R). Ces probabilités peuvent être définies comme la limite de fréquences relatives d’instances possibles de T déclenchant une instance de R sur une séquence aléatoire infinie d’instances possibles de T satisfaisant certaines conditions (décrites dans l’article). En suivant une méthodologie faillibiliste, les valeurs numériques de ces propensions peuvent être estimées par les fréquences relatives d’occurrences d’évènements dans des séquences finies.
(2009) Barton, A., Cokely, E.T., Galesic, M., Koehler, A., & Haas, M. Comparing risk reductions: On the dynamic interplay of cognitive strategies, numeracy, complexity and format. Proceedings of the 31st Annual Conference of the Cognitive Science Society. 2347-2352. Austin,TX: Cognitive Science Society.
Cet article de psychologie cognitive présente les résultats d’une analyse de protocole visant à identifier les stratégies cognitives utilisées pour comparer l’efficacité de traitements médicaux. L’expérience examine l’effet des variations de différents facteurs : le format de communication du risque (réduction du disque relative ou absolue ; fréquence ou probabilité d’événement singulier) ; la difficulté de la tâche ; et les compétences numériques des individus. Nous montrons que des individus ayant des compétences numériques développées utilisent plus fréquemment des stratégies complexe ; et que ces individus ont de meilleures performances sur des tâches complexes que les individus ayant une faible numéracie (en revanche, leurs performances deviennent similaires sur des tâches simples). Un format fréquentiste de communication du risque est par ailleurs corrélé à des performances accrues sur des tâches complexes. Enfin, la communication du risque tend à être plus efficace lorsque présentée en termes de réduction du risque absolue (plutôt que relative) ; nous recommandons donc ce format pour la communication d’énoncés de réduction du risque.
(2019) JOWO 2019. The Joint Ontology Workshops, eds. Barton, A., Seppälä, S. & Porello, D., CEUR Workshop Proceedings, Vol. 2518
(2016) Proceedings of the Early Career Symposium, section éditée par Barton, A., Borgo, S. & Bourguet, J.-R.. In JOWO 2016. The Joint Ontology Workshops. Episode 2 – The French Summer (eds. Oliver Kutz & Sergio de Cesare).
(2015) Nudge. Volume édité par Barton, A. & Grüne-Yanoff, T. Review of Philosophy and Psychology, 6(3).
Ce volume comprend dix contributions sur la théorie des nudges, par des spécialistes en philosophie, psychologie, économie, neurosciences et droit, dont un article invité de Gerd Gigerenzer, directeur du Max Planck Institute for Human Development. Le volume comprend également un commentaire de l’ensemble des contributions par Cass Sunstein, co-fondateur de la théorie des nudges.
(2020) Barton, A. L’ontologie appliquée : un dialogue entre métaphysique analytique et traitement de l’information. La philosophie pratique : un passage obligé pour penser la société, 87-108, André Lacroix (Ed.), Presses de l’Université Laval.
(2017) Barton A. L'ontologie est-elle une science ?  Qu'est-ce que la science... pour vous ?, 21-26, Marc Silberstein (Ed.), Editions Matériologiques.
Ce chapitre examine le statut scientifique de l’ontologie, et conclut que l’ontologie appliquée est une science descriptive impliquant une continuité entre travail philosophique et travail scientifique.
(2016) Barton, A. La nature des probabilités dans les systèmes de raisonnement médical bayésien. Le bayésianisme aujourd’hui. Fondements et pratiques, 53-86, Isabelle Drouet (Ed.), Editions Matériologiques
Je présente dans ce chapitre différents systèmes de diagnostic médical automatisé proposés depuis les années 1950 : le bayésianisme naïf ; les systèmes experts ; les réseaux bayésiens ; et les projets en cours visant à intégrer les réseaux bayésiens au sein des ontologies formelles appliquées.
(2014) Barton, A. Understanding probabilities in the Everett interpretation of quantum mechanics. Probing the meaning of Quantum Mechanics: Physical, Philosophical, Mathematical and Logical Perspectives, 209-222, Diederik Aerts, Sven Aerts & Christian De Ronde (Eds.), Singapore:World Scientific.
J’analyse dans ce chapitre ce qu’impliquerait la compréhension du statut des probabilités au sein de l’interprétation d’Everett de la mécanique quantique. Je montre qu’une telle tâche impliquerait de répondre à trois questions : « Que sont les probabilités subjectives ? », « Que sont les probabilités objectives ? », et « Pourquoi un agent rationnel doit-il aligner ses probabilités subjectives sur son estimation des valeurs des probabilités objectives ? ». Je montre comment une conception des probabilités subjectives comme degrés d’attention d’un agent rationnel envers ses différents successeurs, dans la lignée de Hilary Greaves, permettrait de répondre à la première question ; et comment une interprétation des amplitudes quantiques (apparaissant dans la fonction d’onde de l’univers) comme proportions de mondes permet de répondre à la seconde et aide à répondre à la troisième question.
(2013) Barton, A. L’interprétation multi-mondes de la mécanique quantique: enjeux actuels. Précis de Philosophie de la Physique, 93-115, Soazig Le Bihan (Ed.), Paris: Vuibert.
Ce chapitre analyse les problèmes principaux posés par l’interprétation d’Everett de la mécanique quantique, en se concentrant sur la question du statut des probabilités. Je présente dans un premier temps les interprétations des probabilités qui ont été proposées par le passé, et plus particulièrement l’interprétation fréquentiste des probabilités (en dissociant le fréquentisme actuel et le fréquentisme hypothétique), ainsi que l’interprétation subjectiviste des probabilités comme degrés de croyance (proposée par Ramsey et de Finetti). J'explique comment adapter cette dernière au cas d'un univers Everettien; et montre que les proportions de monde postulées par l’interprétation d’Everett peuvent être interprétées selon une interprétation dite « fréquentiste actuelle » des probabilités, qui résout certaines difficultés classiques de l’interprétation fréquentiste.
(2004) Barton, A. Introduction à l'attitude ontologique naturelle. Textes clés de philosophie des sciences, 323-330, Sandra Laugier & Pierre Wagner (Eds.), Paris: Vrin.
Cette introduction à la 'Natural Ontological Attitude' d’Arthur Fine la met en perspective dans un panorama de différentes formes de réalismes et anti-réalismes scientifiques.
(2021) Barton, A., Cumyn, A., Dault, R., Ethier, J.-F. Gift, Reciprocity and Learning Health Systems . The American Journal of Bioethics, 21:4, 91-93, https://doi.org/10.1080/15265161.2021.1891341 (commentaire)
(2015) Barton, A. & Grüne-Yanoff, T. From libertarian paternalism to nudging - and beyond. Review of Philosophy and Psychology, 6(3), 341-359. (éditorial)
Cet éditorial commence par catégoriser les nudges selon les processus cognitifs qu’ils exploitent et les buts auxquels ils visent. Le paternalisme libertarien est alors caractérisé comme une forme spéciale de défense des nudges. Cette défense est cependant affaiblie dans un certain nombre de cas dans lesquels elle est censée être effective. Les nudges peuvent néanmoins être justifiés par des arguments paternalistes standards, par le principe de non-nuisance, ou par des processus de décision démocratiques. Certains nudges peuvent être complémentés ou remplacés par des mesures alternatives, telles que l’éducation ou le ‘boosting’, en fonction de facteurs tels que leur effet sur l’autonomie individuelle ou leur transparence institutionelle. Finalement, les défenseurs des nudges devraient fournir des données empiriques mécanistes pour répondre à certaines préoccupations concernant leur validité externe et des questions normatives.
(2008) Galesic, M., Birnbaum, M., Barton, A., Wegwarth, O., Gaissmaier, W. & Gigerenzer, G. Do analogies help elderly people understand medical information, International Journal of Psychology, vol. 
43, no. 3-4, p. 32. (résumé)
Ce résumé présente des résultats d’expériences de psychologie expérimentale que nous avons menées au Max Planck Institute for Human Development, qui étudient l'influence de certains paramètres influençant la communication du risque. Ces expériences suggèrent que deux paramètres permettent une meilleure mémorisation de l’information, dans une population de personnes âgées ayant de faibles compétences numériques:1) accompagner une communication du risque numérique de mortalité par des analogies, et 2) présenter les conséquences de comportement à risque en termes tangibles plutôt qu’abstraits. La perception de la gravité des risques et de la crédibilité de l’information n’est pas modifiée par l’utilisation de ces analogies.
(2007) Barton, A., Mousavi, S., & Stevens, J.R. A statistical taxonomy and another "chance" for natural frequencies. Behavioral and Brain Sciences, 30, 255-256. (commentaire)
Nous proposons une taxonomie des différents formats possibles de communication de l’information statistique afin de clarifier certaines confusions fréquentes dans la littérature sur le sujet. Cette clarification, combinés à d’autres données empiriques récentes, suggère que les résultats de Barbey & Sloman (parus dans le même journal) ne fournissent pas de soutien empirique à la théorie des processus duels de jugement, contrairement à ce qu’affirment ces auteurs.
(2007) Barton, A. "Giordano Bruno" / "Entité" / "Univers". Dictionnaire de philosophie, 88-89 / 187 / 594-595, Paris: Ellipses.
(2005) Barton, A. Mécanique quantique et vision du monde. Dictionnaire culturel en langue française, 2263-2273, Paris: Le Robert.
Cet article propose une synthèse des problèmes épistémologiques et ontologiques soulevés par la mécanique quantique.
(2023) Le Bihan, B., Barton, A. Métaphysique analytique, métaphysique naturalisée et ontologie appliquée. Traduction française de B. Le Bihan, A. Barton «  Analytic Metaphysics Versus Naturalized Metaphysics: The Relevance of Applied Ontology ». Erkenntnis, 86, 21-37., Métaphysique et Sciences, Nouveaux problèmes, 199-225, R. Künstler & C. Tiercelin (Eds.), Paris: Hermann.
(2008) Barton, A. Traduction française de M. Stölltzner, « Can meaning criteria account for indeterminism? Moritz Schlick on causality and verificationism in quantum mechanics », Les mathématiques et l’expérience. L'empirisme logique à l'épreuve (1918-1940), 273-302, J. Bouveresse & P. Wagner (Eds.), Paris: Odile Jacob.
(2004) Barton, A. Traduction française de A. Fine, « The Natural Ontological Attitude », Chapitre 7 de The Shaky Game (1996, The University of Chicago Press), Textes clés de philosophie des sciences, tome II, 331-372, S. Laugier & P. Wagner (Eds.), Paris: Vrin.